真菌的分類系統(tǒng)很多．各派分類論點(diǎn)各不相同．下面僅介紹其中的兩種較有代表性的真菌分類系統(tǒng)。

1．安斯沃思(G．C．Ainsworth 1971，1973)的分類系統(tǒng)

該系統(tǒng)在whittake將真菌獨(dú)立成界的基礎(chǔ)上．將真菌界分為兩個(gè)門(真菌門和黏苗門)．在真菌門內(nèi)根據(jù)有性孢子的類型、菌絲是否有隔膜等性狀分為j個(gè)亞門，即鞭毛菌亞門、接合菌亞門、子囊菌亞門、擔(dān)子菌亞門和半知菌亞門(表2 2)。這一分類系統(tǒng)在20世紀(jì)較有影響．但顯然這一系統(tǒng)仍屬 人為分類 而非真正按親緣關(guān)系和客觀反應(yīng)系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系對(duì)真菌進(jìn)行的 自然分類 。

2.《真菌字典》的分類系統(tǒng)

1995年，根據(jù)18S rRNA序列的研究、生物化學(xué)和細(xì)胞壁組分以及DNA序列分析的結(jié)果．國(guó)際真菌學(xué)研究的機(jī)構(gòu) 英國(guó)國(guó)際真菌研究所(Internatlorlal Mycological Institu te)出版的第8版《真菌詞典》(Dictlonary of Fungi)中．將原來的真菌界劃分為原生動(dòng)物界、藻界和真菌界。真菌界僅包括了4個(gè)門，即壺菌門、接合菌門、子囊菌門和擔(dān)子菌門。卵菌、絲壺和網(wǎng)黏菌被發(fā)現(xiàn)與硅藻類和褐藻類具有近緣關(guān)系，這一類群被稱為藻界，而其他黏菌被認(rèn)為屬于啄生動(dòng)物界?！墩婢~典》的分類系統(tǒng)較之安斯沃思的分類系統(tǒng)有了進(jìn)步，但是否是代表真正的 自然分類 則仍需探討。2008年出版了《真菌詞典》第10版，說明該系統(tǒng)代表了現(xiàn)代真菌分類的方向。

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