新冠肺炎疫情牽動著每一個人的心。全力做好肺炎疫情防控工作,是華大智造和社會各界的共同目標。面對這場沒有硝煙的戰(zhàn)爭,華大智造DNBSEQ系列高通量基因測序儀被用于基因組序列組裝,疑似患者檢測,變異檢測等肺炎防控關鍵時刻。
MGISEQ-2000成為最早發(fā)布新型冠狀病毒基因組測序儀之一
MGISEQ-2000作為中高通量測序儀,在臨床和科研上都廣泛使用,在全國各地本地化數(shù)據(jù)測序、助力分析新冠病毒基因組序列等發(fā)揮了重要作用。
MGISEQ-2000
12月30日,在最早一批提交至全球共享流感病毒數(shù)據(jù)庫GISAID發(fā)布的13例新型冠狀病毒基因組序列數(shù)據(jù)中,有5例數(shù)據(jù)來自華大智造高通量測序儀——MGISEQ-2000,這為研究分析武漢新型冠狀病毒的進化來源、致病病理機制提供了第一手資料。
基于MGISEQ-2000技術平臺提交的序列數(shù)據(jù)
1月23日,MGISEQ-2000在北京緊急檢測任務中發(fā)揮了至關重要的作用,接到任務后,快速進行建庫、上機,在1月25日凌晨3點成功下機。同一時間,在全球共享流感病毒數(shù)據(jù)庫GISAID數(shù)據(jù)庫中,已公開發(fā)布的新型冠狀病毒基因組序列已增加至26例【1】。
新型冠狀病毒2019-nCoV基因組結構示意圖
(來源:Nextstrain)
1月25日,在深圳某醫(yī)院MGISEQ-2000配合臨床診療過程需要,參與溯源分析和研究。
1月27日,位于北京的MGISEQ-2000再次發(fā)揮了其全面靈活、質量穩(wěn)定、測序速度快等優(yōu)勢。作為核酸檢測試劑盒(PCR方法)的補充,對于部分病毒含量較低的樣本,基于MGISEQ-2000高通量測序儀進行測序,可以提高陽性檢出率,避免漏檢和錯檢;對于疑似感染、多重感染或繼發(fā)感染病原樣本,而基于DNBSEQ高通量測序儀進行測序,可以進行并發(fā)檢測,提供更多可能感染的病原信息。
華大智造高通量測序儀MGISEQ-2000在路上
超高通量測序儀DNBSEQ-T7成為規(guī)?;瘷z測重器
年末歲初,武漢,在中國科學院微生物研究所、山東第一醫(yī)科大學和華大基因的通力合作下,來自華大智造的DNBSEQ-T7出色完成基因組測序任務,快速完成該新型冠狀病毒組測序?!?】
基于DNBSEQ-T7的4個樣本組裝文件
1月21日,緊急新增的DNBSEQ-T7測序儀連夜部署,最快可在20小時內對128個病例實現(xiàn)從樣本到下機報告的輸出,且每個樣本經高通量測序獲得的總Reads數(shù)超過100 Million reads,能有效提高病原微生物的檢測靈敏度。
領域應用專家在DNBSEQ-T7前進行上機操作
除此之外,1月22日,位于上海、廣州等地的DNBSEQ高通量測序儀——MGISEQ-200也完成數(shù)據(jù)更新,更新后的數(shù)據(jù)庫包含引新型冠狀病毒序列。
華大智造成立應急專項小組,開通技術支持專線
為了更好支持各地區(qū)測序儀的運作,華大智造成立應急專項小組、開通應急技術支持專線,24小時待命,共同助力疫情防控。在全國配備精銳力量,24小時待命,提供基于高通量測序方法的新型冠狀病毒應急方案,支持臨床鑒別提供診斷依據(jù)包括新型冠狀病毒在內的其他冠狀病毒和呼吸道病原感染,實現(xiàn)病毒序列快速檢測,并為監(jiān)測可能存在的病毒變異提供支持。
華大智造也開通了應急技術支持專線(4000-966-988,按語音提示輸入5,即可實現(xiàn)呼叫),全力協(xié)助疫情防控。
華大智造2019-nCoV高通量測序解決方案總聯(lián)系人
江博士,15972014336
華大智造2019-nCoV全國各區(qū)應急小組組長
華北區(qū):杜先生,18911279162
華東區(qū):趙先生,17621034555
華南區(qū):曾先生,18718924024
華中區(qū):蔣先生,13681802511