把埃博拉病毒基因組測(cè)序監(jiān)測(cè)系統(tǒng)裝進(jìn)行李箱實(shí)現(xiàn)實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)并不是夢(mèng)。英國(guó)伯明翰大學(xué)Nicholas Loman團(tuán)隊(duì)開發(fā)了一個(gè)基因組監(jiān)測(cè)系統(tǒng),可以用標(biāo)準(zhǔn)的航空行李運(yùn)送到疾病檢測(cè)現(xiàn)場(chǎng),并在樣本收集24小時(shí)內(nèi)得出檢測(cè)結(jié)果。近日發(fā)表于《自然》的一項(xiàng)研究介紹了在西非幾內(nèi)亞最近的埃博拉疫情中,成功使用該系統(tǒng)進(jìn)行的實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)。
西非埃博拉病毒新瑪可拉(Makona)毒株已導(dǎo)致超過(guò) 11000人死亡,該病毒平均每個(gè)基因組中有16~27個(gè)遺傳變異?;蚪M測(cè)序可以用來(lái)追蹤這種變化,且日益受到醫(yī)護(hù)工作者的歡迎,因?yàn)橹灰獪y(cè)序結(jié)果分析得足夠快,就可以給他們提供信息并采取病毒控制措施。然而,由于當(dāng)?shù)厝鄙贉y(cè)序能力,且遠(yuǎn)距離運(yùn)輸樣本測(cè)序有難度,西非埃博拉疫情期間采取基因組監(jiān)控十分零散。
Loman團(tuán)隊(duì)開發(fā)的基因組監(jiān)測(cè)系統(tǒng)使用一個(gè)重量不足100克的DNA測(cè)序裝置,既可以用標(biāo)準(zhǔn)航空行李運(yùn)送,也可以插入筆記本電腦的USB接口。研究團(tuán)隊(duì)使用該系統(tǒng)測(cè)序并且分析了2015年3~10月收集的142例埃博拉病毒樣本,并可在24小時(shí)內(nèi)得到分析結(jié)果,測(cè)序過(guò)程需要的時(shí)間尚不到1小時(shí)。研究者認(rèn)為,這顯示出在資源缺乏的情況下進(jìn)行實(shí)時(shí)基因組監(jiān)控是可行的。