產(chǎn)品及特點(diǎn)
扎伊爾埃博拉病毒(Zaire Ebola Virus,ZEBO)是一種RNA病毒,是一種能引起人類和其他靈長(zhǎng)類動(dòng)物產(chǎn)生埃博拉出血熱的烈性傳染病病毒,其引起的埃博拉出血熱是當(dāng)今世界上致命的病毒性出血熱,感染者癥狀與同為纖維病毒科的馬爾堡病毒極為相似,包括惡心、嘔吐、腹瀉、膚色改變、全身酸痛、體內(nèi)出血、體外出血、發(fā)燒等。死亡率在50%至90%之間,致死原因主要為中風(fēng)、心肌梗塞、低血容量休克或多發(fā)性器官衰竭,因此快速準(zhǔn)確鑒定對(duì)該病的預(yù)防和檢疫有著重要作用。本產(chǎn)品基于PCR原理開發(fā)。它具有下列特點(diǎn): 一站式,用于不需要單獨(dú)準(zhǔn)備每種成分,包括引物和對(duì)照。根據(jù)扎伊爾埃博拉病毒的保守基因序列設(shè)計(jì)的引物,具有良好的特異性。基于染料法qRT-PCR檢測(cè),靈敏度比常規(guī)RT-PCR高10-100倍,可以達(dá)到至少1000拷貝/反應(yīng)。使用一管式qRT-PCR技術(shù),RT和PCR兩步在一個(gè)試管內(nèi)完成,不需要中間轉(zhuǎn)移樣品,降低了操作誤差和可能的污染。本產(chǎn)品足夠50次30 L體系的RT-PCR,只能用于科研,不能用于臨床。
規(guī)格及成分
成 份
編號(hào)
十孔盒包裝
2 qRT-PCR 緩沖液
190101a
500 L(棕色管)
10 qRT-PCR酶混合液
190101b
100 L(紅蓋)
ROX染料I
190101c
50 L(棕色管)
ROX染料II
190101d
50 L(棕色管)
熒光PCR模板稀釋液
180701
1mL(亮黃蓋)
扎伊爾埃博拉病毒RT-PCR引物混合液
14-30050yw
100 L(白蓋)
扎伊爾埃博拉病毒RT-PCR陽性對(duì)照
(1 10E8拷貝/ L)
14-30050pc
50 L(黃蓋)
天凈沙核酸釋放劑試用裝
61202
20次(1mL,綠蓋)
使用手冊(cè)
14-30050sc
1份
運(yùn)輸及保存
低溫運(yùn)輸,-20℃保存,保存期限為12個(gè)月。陽性對(duì)照需要因易污染其他成分需要單獨(dú)放置。本產(chǎn)品不提供活體樣品做陽性對(duì)照,只提供RNA段作為陽性對(duì)照。
自備試劑
樣品RNA
使用方法
一、稀釋陽性對(duì)照(以10E2-10E7這6個(gè)10倍稀釋度為例。由于標(biāo)準(zhǔn)品濃度非常高,因此下列稀釋操作一定要在獨(dú)立的區(qū)域進(jìn)行)。為增加產(chǎn)品穩(wěn)定性和避免擴(kuò)散傳染性病原。標(biāo)記6個(gè)離心管,分別為7,6,5,4,3,2。用帶芯槍頭分別加入45 L 熒光PCR模板稀釋液,用帶芯槍頭,下同)。在7號(hào)管中加入5 L 1 10E8拷貝/ L 的陽性對(duì)照(本試劑盒提供),充分震蕩1分鐘,得1 10E7拷貝/ L的陽性對(duì)照。放冰上待用。換槍頭,在6號(hào)管中加入5 L 1 10E7拷貝/ L 的陽性對(duì)照(上步稀釋所得),充分震蕩1分鐘,得1 10E6拷貝/ L的陽性對(duì)照。放冰上待用。換槍頭,在5號(hào)管中加入5 L 1 10E6拷貝/ L 的陽性對(duì)照(上步稀釋所得),充分震蕩1分鐘,得1 10E5拷貝/ L的陽性對(duì)照。放冰上待用。重復(fù)上面的操作直到得到6個(gè)稀釋度的陽性對(duì)照。放冰上待用。
二、樣品RNA的制備如果有N個(gè)樣品,必須設(shè)置N+2個(gè)提取,多出的一個(gè)是PC(樣品制備陽性對(duì)照),一個(gè)是NC(樣品制備陰性對(duì)照)。可以用10 L上步制備的陽性對(duì)照梯度稀釋液中的第4號(hào)(濃度為1 10E4拷貝/ L,10 L相當(dāng)于1萬拷貝)再加上一定量的水作為制備的陽性對(duì)照(加水后其總體積跟樣品一樣,樣品體積多少取決于所用試劑盒的要求)。可以用水作為制備的陰性對(duì)照。用自選方法純化N+2個(gè)樣品的RNA,本試劑盒跟市場(chǎng)上大多數(shù)病毒RNA提取試劑盒兼容。本試劑盒免費(fèi)贈(zèng)送20次免RNA提取的天凈沙核酸釋放劑試用裝
三、設(shè)置RT-PCR反應(yīng)(20 L體系,在樣品制備室進(jìn)行)如果做定量分析并且只做1次重復(fù),則標(biāo)記N+9個(gè)PCR管,其中N+2個(gè)用于上步得到的N+2個(gè)樣品,1個(gè)用于PCR陰性對(duì)照,6個(gè)用于標(biāo)準(zhǔn)曲線。如果做定性分析,并且只做1次重復(fù),則標(biāo)記N+4個(gè)PCR管,其中N+2個(gè)用于上步得到的N+2個(gè)樣品,1個(gè)用于PCR陰性對(duì)照(用水做模板),1個(gè)用于PCR陽性對(duì)照(用第4號(hào)陽性對(duì)照稀釋液做模板)。下面只描述定量分析的步驟,定性分析只是把6個(gè)標(biāo)曲反應(yīng)縮減成1個(gè),其余不變。在標(biāo)記管中按下表加入各成分(本表只列出一次重復(fù)。樣品管和陰性對(duì)照設(shè)置完畢后才設(shè)置陽性對(duì)照,陽性對(duì)照樣品要等所有管子蓋上蓋子后后加):
成分
N+2個(gè)制備所得樣品
RT-PCR陰性對(duì)照
RT-PCR陽性
對(duì)照(2-7管)
2 qRT-PCR 緩沖液
10 L
10 L
各10 L
口蹄疫病毒RT-PCR
引物混合物
2 L
2 L
各2 L
50 ROX (見注)
0.4 L
0.4 L
各0.4 L
樣品制備所得RNA模板(來于第8步)
5.6 L
不加
不加
稀釋所得6個(gè)陽性對(duì)照(來于第6步)
不加
不加
各5.6 L(2號(hào)樣到2號(hào)管,3號(hào)樣到3號(hào)管 )
10 qRT-PCR
酶混合液
2 L
2 L
2 L
注:需使用ROX染料I的機(jī)型:ABI Prism7000、7300、7700、7900HT、Step-One、Step-One Plus。
需使用ROX染料II的機(jī)型::ABI Prism 7500、7500Fast、MJ Research的Chromo4、Opticon(II)Corbett Rotor Gene 3000。
不需要使用ROX的機(jī)型:Thermal Cycle Dice Real Time System, LightCycler、Smart Cycler System、Agilent Mx3000P、RotorGene 3000、RotorGene 6000。上機(jī)后按下面參數(shù)進(jìn)行RT-PCR(參數(shù)可能會(huì)因儀器不同而需優(yōu)化)。
過程
溫度
時(shí)間
RT(逆轉(zhuǎn)錄)
50℃
15-30分鐘
預(yù)變性
94℃
2分鐘
RT - PCR反應(yīng)
(30個(gè)循環(huán))
95℃
15 秒
60℃
15 秒(采集FAM通道的熒光信號(hào))
72℃
15 秒
按儀器預(yù)設(shè)程序進(jìn)行溶解曲線分析數(shù)據(jù)處理如果把本試劑盒用于定量檢測(cè),則以陽性對(duì)照濃度的log值為橫軸,以Ct值為縱軸,繪制標(biāo)準(zhǔn)曲線。再以待測(cè)樣品的Ct值從標(biāo)準(zhǔn)曲線上推算出樣品RNA濃度的log值,再推算出其濃度。如果把本試劑盒用于定性檢測(cè),只判斷陽性或陰性,則陰性對(duì)照Ct必須大于或等于40。陽性對(duì)照必須有熒光對(duì)數(shù)增長(zhǎng),有典型擴(kuò)增曲線,Ct值應(yīng)該小于或等于30。對(duì)待測(cè)樣品,如果其Ct大于或等于40則為陰性,如果小于或等于35則為陽性。如果在35-40之間,則重復(fù)一次。重復(fù)實(shí)驗(yàn)的Ct值如果大于或等于40則為陰性,如果小于40,則為陽性。
關(guān)聯(lián)產(chǎn)品
扎伊爾埃博拉病毒可視化RT-LAMP檢測(cè)試劑盒