用于和DNA或RNA結(jié)構(gòu)類(lèi)似的寡核苷酸合成的自動(dòng)化儀器,即是DNA合成儀。通常用于固相合成法,每次在長(zhǎng)的寡核苷酸鏈上接入一個(gè)核苷酸。加入每一個(gè)核苷酸均通過(guò)相同的化學(xué)反應(yīng)和相應(yīng)的嘌呤或嘧啶堿基衍生物作用。儀器不同,所用化學(xué)反應(yīng)和操作細(xì)節(jié)也會(huì)隨之發(fā)生變化。DNA合成的磷酸酰胺法得到了非常廣泛的應(yīng)用。
操作步驟
亞磷酰胺DNA合成的試劑:
氨水切除溶液
乙腈清洗溶劑
12氧化混合物
三lv乙酸(TCA)脫保護(hù)溶液
N—甲基咪唑封閉試劑
乙酐
四唑偶聯(lián)催化劑
A、G、C、T亞磷酰胺單體
保護(hù)堿基的5/—DM
以以亞磷酰胺寡核苷酸合成為例,操作步驟如下:
1、對(duì)合成儀上所有試劑瓶中的試劑量認(rèn)真檢。
2、在合成儀上裝上標(biāo)記好的干凈的收集瓶。
3、在合成儀中輸入要合成的DNA序列。
4、對(duì)選擇的合成步驟進(jìn)行檢查。
5、選擇結(jié)束方法:儀器的原始狀態(tài)為T(mén)ritylOffAuto,如果想要通過(guò)5,—DMT基團(tuán)連接純化寡核苷酸,那么將其轉(zhuǎn)變?yōu)門(mén)ritylOnAuto結(jié)束狀態(tài)。
6、選擇結(jié)束方法通常是為系統(tǒng)的原始狀態(tài)。
7、將你所希望的保存名字輸入到每個(gè)柱監(jiān)視器的Username下。
8、每一個(gè)收集瓶相應(yīng)的DNA序列標(biāo)記用代碼代替。
9、將每一個(gè)柱設(shè)置的詳細(xì)資料打印出來(lái)。
10、對(duì)打印出來(lái)的資料進(jìn)行檢查,判斷是否正確。
11、為了確保合成儀上合成柱處于正確的位置,運(yùn)行StartColumn步驟對(duì)每一個(gè)柱的位置進(jìn)行檢查。
12、對(duì)是否充滿連接在合成儀上的溶劑殘留(廢液瓶)進(jìn)行檢查。
13、保證試管充分清潔干凈,保證DMT廢液管路通向分部收集器。
14、將循環(huán)啟動(dòng),運(yùn)行開(kāi)始程序?qū)υ噭┕苈愤M(jìn)行清洗,將原來(lái)的試劑除去。
日常維護(hù)
1.流路節(jié)流閥
應(yīng)該1個(gè)月清洗1次節(jié)流閥,以避免阻塞,清洗時(shí),先在水中煮沸15min,然后再在甲醇中超聲波清洗。
2.儲(chǔ)液瓶
需要保持氬氣壓力以及管路清潔。瓶子在亞磷酰胺及儲(chǔ)液瓶位置上放置。
3.瓶塞“O”形環(huán)
至少對(duì)“O”形環(huán)一月檢查一次,1年更換1次。比較儀器上的“O”形環(huán)與新的備用“O”形環(huán),若有白色沉淀出現(xiàn)在“O”形環(huán)上,用棉花蘸取乙腈進(jìn)行清洗。
2005-09-19 1068次
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DNA合成儀結(jié)構(gòu)
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