美國(guó)國(guó)家癌癥研究所—治療選擇分子分析 (MATCH) 試驗(yàn)使用Ion Torrent靶向測(cè)序技術(shù)對(duì)無數(shù)腫瘤樣本進(jìn)行測(cè)序

芝加哥-2015美國(guó)臨床腫瘤學(xué)會(huì)(ASCO) 年會(huì)-（2015年6月1日）訊— 一項(xiàng)新的國(guó)家腫瘤學(xué)臨床試驗(yàn)將招募多達(dá)1,000名美國(guó)患者，該試驗(yàn)將使用Thermo Fisher Scientific的靶向二代測(cè)序 (NGS) 技術(shù)獲取基因測(cè)序信息。今日，美國(guó)聯(lián)邦藥品管理局 (FDA) 在美國(guó)臨床腫瘤學(xué)會(huì) (ASCO) 年會(huì)上宣布，美國(guó)國(guó)家癌癥研究所-治療選擇分子分析 (NCI-MATCH) 項(xiàng)目正被引入與ECOG-ACRIN合作，并且已經(jīng)獲得實(shí)驗(yàn)性新藥 (IND) 授權(quán)。

NCI-MATCH試驗(yàn)將采用遍布全國(guó)的2,400多個(gè)區(qū)域性設(shè)施，對(duì)NCI支持的國(guó)家臨床試驗(yàn)網(wǎng)絡(luò)開放。為了支持該研究，馬里蘭州弗里德里克市 NCI分子鑒定實(shí)驗(yàn)室、休斯頓德克薩斯大學(xué)安德森癌癥中心、波士頓馬薩諸塞綜合醫(yī)院和康涅狄格州紐黑文市耶魯大學(xué)將對(duì)多達(dá)3,000個(gè)腫瘤樣本進(jìn)行測(cè)序。這些地方都將采用使用Thermo Fisher的Oncomine試劑和Ion Torrent測(cè)序系統(tǒng)開發(fā)的標(biāo)準(zhǔn)NGS操作流程。

這種靶向測(cè)序方法只需極少的樣本量（DNA和RNA）且在Ion Torrent上的周轉(zhuǎn)時(shí)間更快，可為大量不同類型腫瘤樣本，包括少量活檢和細(xì)針抽吸活檢，提供精確可靠的測(cè)序分析。

“這種規(guī)模和類型的臨床試驗(yàn)必須依賴于技術(shù)，這種技術(shù)應(yīng)該能夠通過對(duì)福爾馬林固定石蠟包埋的活檢標(biāo)本或細(xì)針吸取標(biāo)本中少量DNA和cDNA進(jìn)行一次檢驗(yàn)即可精密檢測(cè)大范圍稀有基因改變，”ECOG-ACRIN實(shí)驗(yàn)室的領(lǐng)導(dǎo)、安德森癌癥中心病理學(xué)和實(shí)驗(yàn)室醫(yī)學(xué)主管Stanley R. Hamilton博士說道?！澳軌驖M足這些需求，是我們?cè)谕瓿稍u(píng)估程序后選擇該平臺(tái)的主要決定因素。這些相同的檢測(cè)需求將有助于實(shí)現(xiàn)精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)?！?/p>

靶向測(cè)序檢測(cè)包括使用oncomine Knowledgebase選出的143個(gè)基因，oncomine Knowledgebase是世界上最大的腫瘤學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)，也是制藥公司、合約研究機(jī)構(gòu) (CROs) 和轉(zhuǎn)化研究實(shí)驗(yàn)室長(zhǎng)期信任的資源。獨(dú)特的Panel設(shè)計(jì)實(shí)現(xiàn)了同時(shí)對(duì)大量基因變化進(jìn)行測(cè)序，包括單核苷酸變異 (SNV) 、小插入和缺失 (indels) 、拷貝數(shù)改變和染色體異位。

根據(jù)這些測(cè)序結(jié)果，研究領(lǐng)導(dǎo)可以將項(xiàng)目參與者按照與他們腫瘤相關(guān)的基因改變類型分配到不同的實(shí)驗(yàn)組中，而不是按照他們的癌癥類型進(jìn)行分配。該試驗(yàn)將包括約20種或更多來自多個(gè)制藥合作公司的藥物。類似于NCI-MATCH的多組研究設(shè)計(jì)允許研究者布下更大的網(wǎng)，有助于將相對(duì)罕見的腫瘤突變考慮進(jìn)來，并促進(jìn)有前景的新療法的發(fā)展。

“這種規(guī)模的研究是無法使用一個(gè)樣品、一個(gè)標(biāo)記物的傳統(tǒng)檢測(cè)方法完成的，”Thermo Fisher執(zhí)行副總裁、生命科學(xué)解決方案業(yè)務(wù)部門總裁Mark Stevenson說道?！斑@是第一個(gè)將本著奧巴馬總統(tǒng)精準(zhǔn)醫(yī)療計(jì)劃的精神展開的國(guó)家腫瘤學(xué)試驗(yàn)，這將可能轉(zhuǎn)變癌癥治療的未來。”

oncomine Comprehensive Assay和Ion PGM僅用于研究用途，不可用于診斷操作。

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