第二屆電鏡網(wǎng)絡(luò)會議(iCEM 2016)特邀報告

生物冷凍電鏡大數(shù)據(jù)中的高效處理方法

張法 副研究員

中國科學(xué)院計算技術(shù)研究所

報告摘要：

　　近年來，隨著成像設(shè)備和處理方法的飛速發(fā)展，冷凍電鏡三維重構(gòu)技術(shù)已成為確定生物大分子三維結(jié)構(gòu)的第一選擇，生物學(xué)家利用冷凍電鏡解析了大量生物大分子的高分辨率三維結(jié)構(gòu)。我國已具有全世界最先進(jìn)和最大規(guī)模的冷凍電鏡硬件實施，這些設(shè)施每天都在產(chǎn)生海量的生物大數(shù)據(jù)。如何對冷凍電鏡大數(shù)據(jù)進(jìn)行高效處理已成為計算科學(xué)所面臨的關(guān)鍵科學(xué)問題。本報告將從科學(xué)計算的角度討論冷凍電鏡數(shù)據(jù)處理中的科學(xué)問題，并介紹本領(lǐng)域最近的研究成果。

報告人簡介：

　　張法，博士，中國科學(xué)院計算技術(shù)研究所副研究員，博士生導(dǎo)師。CCF生物信息學(xué)專業(yè)組委員，秘書長。中國生物物理學(xué)會冷凍電鏡顯微學(xué)分會理事。2002-2005年，作為國際交換學(xué)生在美國俄亥俄州立大學(xué)(Ohio State University)客座訪問，2009-2010年，在西班牙胡安卡洛斯國王大學(xué)(Universidad Rey Juan Carlos)進(jìn)行客座訪問。

　　長期從事生物信息學(xué)和高性能計算方面的研究，目前主要從事生物大分子冷凍電鏡三維重構(gòu)方面的研究。作為項目負(fù)責(zé)人和主要參與人主持和參與了多項國家自然科學(xué)基金重點(diǎn)項目、國際合作重大項目、中科院知識創(chuàng)新重大項目、中科院戰(zhàn)略性先導(dǎo)項目(B類)等多項國家項目，作為第一作者或通信作者在國內(nèi)外著名期刊和國際會議上發(fā)表論文60余篇。開發(fā)完成了國內(nèi)首款冷凍電鏡三維重構(gòu)系統(tǒng)AuTOM，其中電子斷層數(shù)據(jù)對位軟件Markerauto 和三維重構(gòu)軟件ICON已成為本領(lǐng)域知名軟件，幫助生物學(xué)家取得了重要的生物學(xué)發(fā)現(xiàn)。

報告時間：2016年10月26日下午

報名鏈接：