原因不明的感染一向是醫(yī)學(xué)上的難題。在電視劇《外科風(fēng)云》中，在病原檢測(cè)不出的情況下，醫(yī)生只能憑借經(jīng)驗(yàn)嘗試治療。

　　現(xiàn)在，醫(yī)務(wù)人員有了一種新的利器--基于二代基因測(cè)序的病原快檢技術(shù)。這種技術(shù)自進(jìn)入中國(guó)以來(lái)，已經(jīng)在眾多疑難感染患者的診斷中到關(guān)鍵性作用。其中，就包括一位來(lái)自菲律賓的船員。

　　生死時(shí)速，基因科技“秒揪”病原

　　今年7月中旬，唐山萬(wàn)航國(guó)際船務(wù)有限公司的一名菲律賓籍船員從唐山啟程。北京協(xié)和醫(yī)院、華大基因和華北理工大學(xué)附屬醫(yī)院聯(lián)手解決了他的疑難感染，使他得以平安地踏上歸國(guó)之旅。

　　6月2日，這名船員在船上發(fā)生頭痛、左半身偏癱的癥狀。貨輪就近停靠在唐山，患者先在曹妃甸當(dāng)?shù)蒯t(yī)院就診，后轉(zhuǎn)至華北理工大學(xué)附屬醫(yī)院神經(jīng)內(nèi)科一病區(qū)。

　　主治醫(yī)生毛文靜回憶，患者來(lái)院的時(shí)候出現(xiàn)發(fā)熱，左側(cè)瞳孔散大、反射差，左側(cè)手臂完全無(wú)力，意識(shí)也在逐步喪失，情況危重。腰穿檢測(cè)結(jié)果顯示，患者的腦脊液中白細(xì)胞含量高、糖類(lèi)含量低，液體呈微黃色?！案杏X(jué)上像是結(jié)核性腦膜腦炎?！泵t(yī)生說(shuō)，“當(dāng)即就把結(jié)核藥用上了?！?p>　　但醫(yī)院使用常規(guī)的方法，始終沒(méi)有找到結(jié)核菌，因此一直采取多種抗菌藥物并用的保守治療方案。在6月12日，神經(jīng)內(nèi)科主任劉斌教授請(qǐng)來(lái)北京協(xié)和醫(yī)院的關(guān)鴻志教授，對(duì)患者進(jìn)行會(huì)診。

　　在此之前，從2014年起，協(xié)和醫(yī)院神經(jīng)科與華大基因研究院合作，在國(guó)內(nèi)首先開(kāi)展腦脊液二代測(cè)序研究，用于中樞神經(jīng)系統(tǒng)感染性疾病的病原體篩查。關(guān)鴻志教授正擔(dān)任此項(xiàng)目的負(fù)責(zé)人。他提出建議：試試使用二代基因測(cè)序技術(shù)進(jìn)行的病原快檢。

　　6月22日下午，天津華大基因交付病原組收到了患者腦脊液樣本。這項(xiàng)檢測(cè)一般需要2-3天，此次由于感染危重，華大做了加急處理，30個(gè)小時(shí)左右就完成了檢測(cè)流程。23日晚上，檢測(cè)報(bào)告出爐，樣本中檢出了結(jié)核分枝桿菌。

　　獲得了明確的病原信息后，醫(yī)院立即調(diào)整了治療方案，一改之前多管齊下的保守用藥，集中火力向結(jié)核發(fā)起反攻。7月中旬，該患者病情好轉(zhuǎn)、出院回國(guó)，繼續(xù)進(jìn)行抗結(jié)核治療。

菲律賓船員的治療團(tuán)隊(duì)與技術(shù)人員，從左到右依次為：華大基因天津交付李媛，北京協(xié)和醫(yī)院關(guān)鴻志，華北理工大學(xué)附屬醫(yī)院劉斌、李世英、毛文靜

　　廣譜病原檢測(cè)，“十年沉疴”一朝解決

　　現(xiàn)在，利用二代測(cè)序技術(shù)進(jìn)行的病原快檢，比傳統(tǒng)的涂片技術(shù)范圍更廣，比病原培養(yǎng)更加快速。同時(shí)，這項(xiàng)技術(shù)的檢測(cè)范圍與病原數(shù)據(jù)庫(kù)的大小一致，突破了臨床上以往“懷疑什么，檢測(cè)什么”的限制，是對(duì)抗不明原因感染的新利器。

　　在二代測(cè)序技術(shù)普及之前，一旦出現(xiàn)癥狀不典型的感染，往往需要依賴(lài)醫(yī)務(wù)人員的經(jīng)驗(yàn)，通過(guò)涂片、培養(yǎng)等方式進(jìn)行針對(duì)性檢查，常造成病情貽誤。關(guān)鴻志說(shuō)：“以前在顱內(nèi)感染中，可能有50%的病人--甚至更多的病人，是診斷不清的。試驗(yàn)性治療治好了就治好了，治不好那就??”

　　關(guān)鴻志講到，有位內(nèi)蒙古的患者從2007年起持續(xù)頭疼、發(fā)熱，十年間輾轉(zhuǎn)多家醫(yī)院，都沒(méi)有得到確診，按照各種感染治療也未痊愈，經(jīng)常需要靠輸液來(lái)降低顱壓，生活十分痛苦。

　　十年后，這位患者的治療終于迎來(lái)轉(zhuǎn)機(jī)。2016年12月，華大基因和協(xié)和醫(yī)院等多個(gè)單位發(fā)起了針對(duì)不明病因腦炎腦膜炎的多中心研究，該患者最初就診的醫(yī)院作為中心之一，重新關(guān)注起這個(gè)“老”病例。今年5月，該患者的樣本送到華大基因進(jìn)行檢測(cè)，結(jié)果竟然為腦囊蟲(chóng)病。協(xié)和醫(yī)院針對(duì)腦囊蟲(chóng)進(jìn)行血清學(xué)篩查，很快證實(shí)病因?，F(xiàn)在，經(jīng)過(guò)對(duì)癥治療，該患者已經(jīng)基本痊愈。

　　“二代測(cè)序的方法，不會(huì)說(shuō)懷疑你是什么感染就查什么感染。它會(huì)把你腦脊液里的核酸都測(cè)一遍，再看看這些核酸分別屬于哪種細(xì)菌、哪種病毒，包括哪種蟲(chóng)子。” 關(guān)鴻志說(shuō)。

　　二代測(cè)序病原快檢將助力民生

　　更廣、更快、更準(zhǔn)確，是二代基因測(cè)序病原快檢技術(shù)的優(yōu)勢(shì)。例如，華大基因的技術(shù)可以同時(shí)檢測(cè)2700多種病原微生物和寄生蟲(chóng)，只要每毫升樣本液體中有100到1000個(gè)核酸片段的拷貝，就能檢測(cè)出來(lái)，鑒定的種屬準(zhǔn)確率大于99%。

　　華大基因是中國(guó)最早利用基因測(cè)序技術(shù)進(jìn)行病原檢測(cè)的單位之一。早在2003年，華大基因就和相關(guān)單位合作，完成了中國(guó)第一例SARS病毒的基因組測(cè)序，并向全國(guó)防治非典型肺炎指揮部捐贈(zèng)30萬(wàn)人份自行研制的SARS病毒診斷試劑盒。

　　利用基因測(cè)序技術(shù)進(jìn)行病原快檢，不但要求一定的測(cè)序能力，還需要完整的病原數(shù)據(jù)庫(kù)建設(shè)、算法匹配和分析運(yùn)算能力、精確解讀的能力。這項(xiàng)技術(shù)在國(guó)外已經(jīng)趨于成熟，相關(guān)的科研項(xiàng)目已經(jīng)在國(guó)內(nèi)開(kāi)展，“技術(shù)科普”和整個(gè)行業(yè)正當(dāng)風(fēng)口。

　　天津華大基因交付病原組的李媛說(shuō)：“到今天，臨床的檢測(cè)了1276例，送檢單位主要集中在北京和上海?！苯y(tǒng)計(jì)顯示，華大收到的樣本中八成以上來(lái)自北京的醫(yī)院。這些醫(yī)院最先從各個(gè)方面接觸到這項(xiàng)技術(shù)，并對(duì)合適的患者加以應(yīng)用。

　　不過(guò)，關(guān)鴻志分析，最需要這項(xiàng)技術(shù)的可能是三四線(xiàn)城市的非三甲醫(yī)院，這些醫(yī)院用傳統(tǒng)方法檢測(cè)病原的能力更低。普及成本較低、廣譜高效的二代測(cè)序病原檢測(cè)技術(shù)，減少不明感染的無(wú)效經(jīng)驗(yàn)治療帶來(lái)的“折騰”，能夠有效地為診斷、為患者、為醫(yī)患關(guān)系減負(fù)，具有重要的民生和社會(huì)意義。