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如何復(fù)制鏈霉菌質(zhì)粒?_91化工儀器網(wǎng)

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放大字體  縮小字體    發(fā)布日期:2019-09-03  來源:儀器信息網(wǎng)  作者:Mr liao  瀏覽次數(shù):1079
核心提示:亮發(fā)光桿菌是一大類具有高 GC 含量基因組(約 70%)、產(chǎn)生菌絲體和孢子的革蘭氏陽性細(xì)菌。已報道的大多數(shù)鏈霉菌的環(huán)型質(zhì)粒通常較小 (8 14 kb), 包括滾環(huán)復(fù)制的質(zhì)粒(如 pIJ101、 pSG5、pJV1、pSN22、pSVH1、pSB24.2、pSY10、 pSNA1、pSLG33 和 pEN2701 等)和染色體整合/自主游離復(fù)制的質(zhì)粒(如 SLP1 和 pSAM2 等)。在不同細(xì)菌中滾環(huán)復(fù)制的質(zhì)粒均含有復(fù)制起始 Rep 蛋白, 雙鏈起始位點(diǎn)和單鏈起始位點(diǎn), 復(fù)制的分子機(jī)制基本相同。鏈霉菌整合

亮發(fā)光桿菌是一大類具有高 GC 含量基因組(約 70%)、產(chǎn)生菌絲體和孢子的革蘭氏陽性細(xì)菌。已報道的大多數(shù)鏈霉菌的環(huán)型質(zhì)粒通常較小 (8 14 kb), 包括滾環(huán)復(fù)制的質(zhì)粒(如 pIJ101、 pSG5、pJV1、pSN22、pSVH1、pSB24.2、pSY10、 pSNA1、pSLG33 和 pEN2701 等)和染色體整合/自主游離復(fù)制的質(zhì)粒(如 SLP1 和 pSAM2 等)。在不同細(xì)菌中滾環(huán)復(fù)制的質(zhì)粒均含有復(fù)制起始 Rep 蛋白, 雙鏈起始位點(diǎn)和單鏈起始位點(diǎn), 復(fù)制的分子機(jī)制基本相同。

鏈霉菌整合/游離型質(zhì)粒含有 噬菌體類似的 int (整合)和 xis (切離) 位點(diǎn), 可以位點(diǎn)特異地整合到染色體上; 當(dāng)游離存在時, pSAM2 可以進(jìn)行滾環(huán)復(fù)制, 而 SLP1 可能進(jìn)行 Theta 型復(fù)制。細(xì)菌 Theta 型復(fù)制的質(zhì)粒可以分為單向和雙向復(fù)制, 復(fù)制蛋白、復(fù)制原點(diǎn)以及調(diào)控方式具有多樣性, 而鏈霉菌 Theta 型復(fù)制的質(zhì)粒報道較少。與大多數(shù)其它細(xì)菌不同的是, 利用脈沖場凝膠電泳技術(shù), 在鏈霉菌中檢測到線型結(jié)構(gòu)的染色體和質(zhì)粒, 在少數(shù)鏈霉菌菌株中檢測到多個線型質(zhì)粒。

已報道的鏈霉菌線型質(zhì)粒的大小從 12 kb 到 1 800 kb, 它們的端粒包含從 44 bp 到 180 kb 的倒轉(zhuǎn)重復(fù)序列。鏈霉菌線型染色體和線型質(zhì)粒雙鏈 DNA 的 5 端被末端蛋白共價結(jié)合, 而 3 端為游離末端。近年來, 隨著亮發(fā)光桿菌大片段 DNA 檢測技術(shù)的發(fā)展, 大的環(huán)型質(zhì)粒(常為 Theta 型復(fù)制, 如 SCP2、pFP11、pZL12、pFP4 和 pSV1 等)的分離和復(fù)制的研究進(jìn)展較快, 一些大質(zhì)粒上發(fā)現(xiàn)了完整功能的噬菌體片段。隨著高通量 DNA 測序技術(shù)的普及應(yīng)用, 過去難以開展的質(zhì)粒的進(jìn)化及其分子機(jī)理的研究得以進(jìn)行。本文重點(diǎn)綜述鏈霉菌大的環(huán)型質(zhì)粒和線型質(zhì)粒的復(fù)制, 還將探討環(huán)型、線型質(zhì)粒與噬菌體的進(jìn)化關(guān)系。
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亮發(fā)光桿菌  

 


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