作為一個群體遺傳學(xué)的術(shù)語，等位基因頻率用來顯示一個種群中基因的多樣性，或者說是基因庫的豐富程度。基因頻率是某種基因在某個種群中出現(xiàn)的比例。基因型頻率是某種特定基因型的個體占群體內(nèi)全部個體的比例。前者是某基因個體數(shù)占全部基因數(shù)的比例，后者是某基因型個體數(shù)占群體總數(shù)的比例。

等位基因頻率的定義如下：

如果 1）一個染色體中存在某特定基因座，2）該基因座上有一個基因，3）一個種群中的每一個個體的體細胞都有n個該特定基因座（例如二倍體生物的細胞中有兩個該特定基因座），4）該基因有等位基因或變種；那么等位基因頻率為-------等位基因在這個種群中 所有該等位基因在特定基因座中所占的百分比。

舉例來說，如果在某種群中一個等位基因的基因頻率為20%，那么在種群的所有成員中，1/5的染色體帶有那個等位基因，而其他4/5的染色體帶有該等位基因的其他對應(yīng)變種－－可以是一種也可以是很多種。

如人們熟悉的人的MN血型，它是由一對共顯性等位基因M和N所決定，產(chǎn)生3種基因型M/M、M/N和N/N，而相應(yīng)的表型是M、MN和N，而且比例是1/4M、1/2MN和1/4N。這個原理可以推廣到一般群體內(nèi)婚配，如以群體中MN表型（基因型）的具體樣本數(shù)被所觀察到總數(shù)相除即可得到（轉(zhuǎn)換）相對頻率數(shù)。

基因頻率是指某種基因在某個種群中出現(xiàn)的比例。對于基因頻率的計算類題目，可以說是高中生物教材中關(guān)于“現(xiàn)代生物進化理論”中的難點，。

1、通過基因型頻率計算基因頻

方法：某種基因的基因頻率＝某種基因的純合體頻率+1/2雜合體頻率

2、通過基因型個數(shù)計算基因頻率

方法：某種基因的基因頻率=此種基因的個數(shù)／（此種基因的個數(shù)+其等位基因的個數(shù)）

3、根據(jù)遺傳平衡定律計算基因頻率

遺傳平衡定律：一個群體在符合一定條件的情況下，群體中各個體的比例可從一代到另一代維持不變。

遺傳平衡定律是由Hardy和Weinberg于1908年分別應(yīng)用數(shù)學(xué)方法探討群體中基因頻率變化所得出一致結(jié)論。符合遺傳平衡定律的群體，需滿足的條件：

（1）在一個很大的群體中；

（2）隨機婚配而非選擇性婚配；

（3）沒有自然選擇；

（4） 沒有突變發(fā)生；

（5）沒有大規(guī)模遷移。

群體的基因頻率和基因型頻率在一代一代繁殖傳代中保持不變。

這樣，用數(shù)學(xué)方程式可表示為： (p+q)2=1,p2+2pq+q2=1，p+q=l。其中p代表一個等位基因的頻率，q代表另一個等位基因的頻率。運用此規(guī)律，已知基因型頻率可求基因頻率；反之，已知基因頻率可求基因型頻率。