對(duì)Greg Merhar來(lái)說(shuō)，測(cè)序全基因組的決定結(jié)束了他這一生的疼痛原因診斷。他的妻子，Debra Leonard博士，最近帶頭進(jìn)行了佛蒙特大學(xué)（UVM）的一項(xiàng)試點(diǎn)研究，對(duì)73名大學(xué)教職員的基因組進(jìn)行測(cè)序。

十三年前，第一個(gè)人類(lèi)基因組的測(cè)序花費(fèi)了近30億美元。如今，每個(gè)基因組的成本已急劇下降至接近1,000美元，因此在不太遙遠(yuǎn)的未來(lái)，這對(duì)患者而言可能是一種越來(lái)越普遍的工具 – 這正是佛蒙特大學(xué)最近的一項(xiàng)試點(diǎn)研究的課題。

Debra Leonard博士，佛蒙特大學(xué)的病理學(xué)主任，希望研究一下：當(dāng)了解一個(gè)人的基因信息后將如何影響人們的健康和幸福。關(guān)于遺傳信息能如何顯著地改變一個(gè)人的生活，她也有著切身體會(huì)：通過(guò)測(cè)序全基因組，她的丈夫終于能夠確定造成他40年嚴(yán)重疼痛的疾病。

Leonard領(lǐng)導(dǎo)了一項(xiàng)試點(diǎn)研究 – 這是與UVM醫(yī)學(xué)院和UVM醫(yī)學(xué)中心的聯(lián)合項(xiàng)目，其中73名大學(xué)醫(yī)生和領(lǐng)導(dǎo)自愿測(cè)序他們的全基因組。

“這個(gè)項(xiàng)目是有些獨(dú)特的，因?yàn)槲覀兿Ｍ葬t(yī)學(xué)上適當(dāng)?shù)姆绞教幚碓S多人的基因組，”Leonard說(shuō)?！拔覀兿Ｍ_保他們?cè)诤炛橥鈺?shū)之前進(jìn)行遺傳咨詢(xún)，知道他們同意做什么?！?p>

Leonard是一位分子病理學(xué)家，已經(jīng)做了24年的基因檢測(cè)。她目前正努力將多種類(lèi)型的檢測(cè)帶到佛蒙特大學(xué)。

“三年前，我來(lái)到這里擔(dān)任病理學(xué)和檢驗(yàn)醫(yī)學(xué)的主任，我的理想是實(shí)施更廣泛的基因組測(cè)序，用于佛蒙特的臨床護(hù)理，”Leonard說(shuō)。

她開(kāi)發(fā)了一個(gè)項(xiàng)目，在患者的腫瘤上開(kāi)展基因檢測(cè)以診斷癌癥，并預(yù)測(cè)患者的預(yù)后。另一項(xiàng)檢測(cè)是篩查患者，看看他們是否存在某些遺傳性癌癥的風(fēng)險(xiǎn)。還有一個(gè)項(xiàng)目是檢測(cè)某些患者，預(yù)測(cè)他們對(duì)不同治療方法的反應(yīng) – 這可以幫助醫(yī)生確定他們開(kāi)的藥適合這個(gè)人。

不過(guò)，她最近的試點(diǎn)項(xiàng)目走得更遠(yuǎn)。

所有DNA的路線(xiàn)圖

Leonard建立了一個(gè)“了解你的基因組（Understand Your Genome）”工作組，其中73名UVM教職工自愿測(cè)序他們的全基因組。這項(xiàng)檢測(cè)將分析每一個(gè)基因 – 人類(lèi)基因組中有超過(guò)30,000個(gè)基因 – 看看參與者是否有可以跟蹤處理的遺傳風(fēng)險(xiǎn)或疾病。

“了解你的基因組計(jì)劃”是由遺傳分析公司Illumina開(kāi)展的。但Leonard希望不僅僅是向人們提供與他們基因有關(guān)的海量數(shù)據(jù)，她希望做得更多。

她設(shè)計(jì)了在測(cè)序前和測(cè)序后與遺傳咨詢(xún)師交談，以確保參與者就他們可能收到的信息——無(wú)論好的、壞的和含糊的——都能獲得適當(dāng)?shù)闹笇?dǎo) 。

Leonard在這一領(lǐng)域工作了二十多年，但她對(duì)全基因組檢測(cè)能帶來(lái)怎樣的驚喜也有切身的感受。

她和她的丈夫Greg Merhar在2014年的圣誕節(jié)給了彼此一份獨(dú)特的禮物：他們每個(gè)人都進(jìn)行了全基因組測(cè)序。

Merhar的Illumina報(bào)告中強(qiáng)調(diào)了三個(gè)“意義不明、但可疑的”基因變異。其中一個(gè)突變是在引起家族性地中海熱（FMF）的基因中。

Merhar認(rèn)為，這是極為不可能的，沒(méi)有任何醫(yī)生想過(guò)檢查這種疾病。

“我有金色的頭發(fā)和藍(lán)色的眼睛，而家族性地中海熱通常與阿拉伯人、土耳其人、亞美尼亞人、西班牙裔和德裔猶太人相關(guān)，”他說(shuō)。

最好的圣誕禮物

近40年來(lái)，Merhar一直忍受著持續(xù)的關(guān)節(jié)疼痛和腹部疼痛。

“我做過(guò)核磁共振和X射線(xiàn)檢查，在我的跟腱中注射過(guò)可的松以及各種各樣的東西，”Merhar說(shuō)。

于是，他開(kāi)始閱讀與FMF基因有關(guān)的東西，發(fā)現(xiàn)它與身體如何調(diào)節(jié)炎癥有關(guān)。他意識(shí)到，這可能是他的關(guān)節(jié)突然發(fā)作和疼痛永遠(yuǎn)得不到解決的原因。

他著實(shí)花了一些力氣，最終說(shuō)服一名風(fēng)濕病專(zhuān)家給他開(kāi)了治療FMF的藥物處方。

“坦白地說(shuō)，我在一個(gè)周五晚上吃了藥，到了周六上午，我感覺(jué)比過(guò)去幾年好多了，”Merhar說(shuō)。

“過(guò)了三四天，我意識(shí)到這些年我有多么痛苦。所有這一切都消失了?！?p>

這是一張Merhar基因組的快照，顯示出引起他疾病的FMF基因變異。頂部的數(shù)字顯示了他的300萬(wàn)個(gè)核苷酸堿基對(duì)中發(fā)生的突變。這么多的數(shù)據(jù)需要分析！

測(cè)序基因組讓Merhar花了5,000美元，他說(shuō)這是他花過(guò)的最值的錢(qián)。

“在吃了幾個(gè)星期的藥后，一天早上我躺在那里，我記不起任何部位的疼痛。而實(shí)際上我的跟腱已經(jīng)縮小了很多，現(xiàn)在我的鞋子比以前小半碼?！?p>

了解也不一定能解決問(wèn)題

自去年以來(lái)，測(cè)序的成本已經(jīng)下降至接近1,000美元。

這與13年前一個(gè)國(guó)際科學(xué)家團(tuán)隊(duì)花費(fèi)近30億美元測(cè)序第一個(gè)人類(lèi)基因組相去甚遠(yuǎn)。

幾十年來(lái)，醫(yī)學(xué)界已經(jīng)知道某些基因與特定疾病相關(guān)聯(lián)，并且能夠檢測(cè)患者的那些變異。

不過(guò)，“像這樣的情況是比較新的，我們實(shí)際上是在測(cè)序表面上健康的人?！惫鸫髮W(xué)的醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)家Robert Green博士這樣說(shuō)。

“因?yàn)槲覀円恢痹趩?wèn)，我們?cè)谒麄兓蚪M里發(fā)現(xiàn)的東西在他們的生命進(jìn)程中是否能在醫(yī)學(xué)上對(duì)他們有用？我們是否能找到疾病的風(fēng)險(xiǎn)因素而讓我們能夠采取應(yīng)對(duì)措施？”Green說(shuō)。

Green最近與佛蒙特大學(xué)的教職員志愿者交談，他們作為“了解你的基因組計(jì)劃”的一部分，測(cè)序了他們的基因組。

他說(shuō)“基因組測(cè)序?qū)σ话愎姸允遣皇且环N合適的篩查方法，我認(rèn)為現(xiàn)在還沒(méi)有定論。”

未知的東西會(huì)不會(huì)傷害我們？

在73名最近接受篩查的UVM教職員中，6個(gè)人收到消息，他們攜帶了一個(gè)可能預(yù)示著嚴(yán)重疾病風(fēng)險(xiǎn)的變異。

現(xiàn)在有幾千種可檢測(cè)的不同遺傳性疾病。不過(guò)即便如此，還是有大量的基因變異，并非所有問(wèn)題都能回答。

例如，Leonard說(shuō)，在科學(xué)家鑒定出導(dǎo)致囊性纖維化的基因之后，他們意識(shí)到，該基因中有許多、許多的變異。

“攜帶這些變異的人并不總是出現(xiàn)全面爆發(fā)的肺和胰腺囊性纖維化，”她說(shuō)?！八麄兛赡芑加新灾夤苎?，可能有慢性鼻竇炎，也可能是不育的?！?p>

目前有一系列疾病，它們與引起囊性纖維化的基因存在關(guān)聯(lián)，Leonard說(shuō)?！拔覀冋诓粩嗔私馕覀兊幕蚪M信息如何發(fā)揮作用?！?p>

Green認(rèn)為，在某些情況下，測(cè)序一個(gè)人的全基因組可能揭示恐怖信息，而科學(xué)還沒(méi)有足夠的了解去應(yīng)對(duì)。

“試想一下，”Green說(shuō)?！凹僭O(shè)你的致病基因中有一個(gè)突變，但放在你面前的那份文檔根本無(wú)法確定你的風(fēng)險(xiǎn)是增加了一點(diǎn)點(diǎn)，增加了中等量，還是增加了很多……這的確讓你和你的醫(yī)生處于非常尷尬的境地?！?p>

但是，科學(xué)家每天都在學(xué)習(xí)有關(guān)基因的新信息。

迄今為止，全世界已有數(shù)百萬(wàn)人進(jìn)行了基因組測(cè)序而作為研究項(xiàng)目的一部分，但那些人并沒(méi)有拿回他們的信息。

只有幾千人 – 包括佛蒙特大學(xué)的73人 – 測(cè)序了基因組，并收到了臨床報(bào)告。當(dāng)然，這種情況正在迅速改變。

來(lái)源：VPR