近期,中科普瑞整合IsoTex-BD China單細胞研究聯(lián)合實驗室經(jīng)過近一年的研發(fā)測試和應用,正式投入科研服務應用。
BD(China)—Sinotech Genomics(中科普瑞)單細胞研究聯(lián)合實驗室
中科普瑞自2018年3月BD(中國)-云泰生物單細胞研究聯(lián)合實驗室成立以來,聯(lián)合實驗室完成了多項技術研發(fā)測試,已獲得了數(shù)百例腫瘤組織的單細胞全轉錄組測序數(shù)據(jù),并針對性設計靶向panel進行驗證,完成合作研發(fā)項目五十余項。
單細胞測序技術在2018年繼續(xù)飛速發(fā)展,各類相關技術和應用紛紛上線,與此同時,單細胞水平轉錄組與蛋白質組的檢測,也逐漸廣泛應用于免疫、癌癥和干細胞等研究領域。BD公司旗下的單細胞平臺—BD Rhapsody作為單細胞研究應用領域的利器,既可通過單細胞全轉錄組和靶向轉錄組測序的整合策略,在單細胞水平構建從新靶標發(fā)現(xiàn)到多樣本驗證的完整研究體系,又可利用其最新的BD? AbSeq assay檢測單細胞水平的蛋白表達,實現(xiàn)特異高效的轉錄組和蛋白組的多組學研究方案。
為了更好地聚焦單細胞腫瘤臨床研究應用,中科普瑞攜其下屬科研服務子公司—上海鯨舟基因推出單細胞研究系統(tǒng)解決方案。立足于BD Rhapsody 單細胞研究平臺開展單細胞全轉錄組和靶向轉錄組測序服務,并以單細胞腫瘤臨床研究為中心,著力進行單細胞甲基化檢測等技術研發(fā)和應用,進而建立涵蓋單細胞甲基化研究、單細胞轉錄組研究以及單細胞蛋白組研究的立體式系統(tǒng)解決方案,為單細胞研究提供新的解決方案和思路。
聚焦單細胞腫瘤臨床研究
腫瘤研究的逐步深入和高通量測序技術的不斷精進促使了精準醫(yī)療策略的提出。而解析腫瘤組織內(nèi)細胞的高度異質性,是實現(xiàn)更精確的癌癥分型,選擇更合理的個體化治療策略的迫切需求。針對腫瘤組織及其免疫微環(huán)境的單細胞轉錄組測序可以幫助科學家繪制腫瘤組織內(nèi)細胞的異質性轉錄組圖譜,通過鑒別腫瘤細胞、基質細胞與浸潤淋巴細胞的不同細胞亞群,來解析不同細胞亞群生物學功能異同,最終構建腫瘤細胞及免疫微環(huán)境的互作網(wǎng)絡,并探究腫瘤細胞產(chǎn)生耐藥或免疫逃逸等機制。
中科普瑞單細胞測序平臺可利用高通量單細胞轉錄組測序技術,通過揭示腫瘤發(fā)生發(fā)展進程中各種細胞亞群轉錄組的變化與差異,助力科學家開展腫瘤的早期診斷、病情監(jiān)測及預后判斷等方面的研究。中科普瑞還與國家大數(shù)據(jù)中心進行戰(zhàn)略合作,結合大數(shù)據(jù)共享和應用分析,通過單細胞轉錄組研究整合多組學和臨床數(shù)據(jù),構建健康與疾病的信息網(wǎng)絡數(shù)據(jù)庫,以期為不同遺傳背景的患者提供個體化診斷及精準治療。
同時,中科普瑞還將利用BD? AbSeq assay這一單細胞蛋白組分析利器,大幅提高客戶對其感興趣的稀有或未知細胞的檢測能力,以促進藥物治療反應、細胞治療等腫瘤免疫學應用研究的進展。
聚焦單細胞甲基化研究
近年來,基于血漿ctDNA甲基化的腫瘤早期診斷、溯源及預后的技術突破,為腫瘤風險篩查和防治提供了新的曙光。DNA甲基化還可用于疾病分型、預后以及用藥指導等臨床領域。單細胞甲基化檢測技術在未來的疾病研究與臨床應用中有著光明前景和無限可能,既可從單細胞水平研究DNA甲基化修飾在組織分化、發(fā)育過程中的特異性,幫助醫(yī)生判斷轉移癌組織的原發(fā)病灶,進而明確診斷疾病;還可針對特定腫瘤組織DNA甲基化修飾的異常,進行對應的診療指導或藥物開發(fā)。
2018年3月以來,中科普瑞作為中國十萬人甲基化組計劃(表觀星圖計劃)的項目實施方,通過與國內(nèi)外基因組隊列計劃聯(lián)動,建立中國人甲基化基準數(shù)據(jù)庫,為表觀遺傳領域研究、應用和臨床檢測等建立基礎數(shù)據(jù)庫。表觀星圖計劃除利用甲基化芯片進行甲基化基準數(shù)據(jù)庫的建立外,還將利用BD(China) — Sinotech Genomics(中科普瑞)單細胞研究聯(lián)合實驗室在單細胞研究方面的技術優(yōu)勢,聚焦單細胞甲基化研究,以期為腫瘤的風險篩查和預防提供新的手段。