91儀器信息使用納米孔,研究人員已經(jīng)證明了將糖胺聚糖測序所需的時間從幾年減少到幾分鐘的潛力。糖胺聚糖是一種長鏈連接的糖分子,其生物學(xué)意義與DNA一樣重要。
本周發(fā)表在《美國國家科學(xué)院院刊》上的研究顯示,倫斯勒理工學(xué)院的一個小組表明,機(jī)器學(xué)習(xí)和圖像識別軟件可以根據(jù)糖鏈穿過晶片上的一個小孔時產(chǎn)生的電信號,快速準(zhǔn)確地識別糖鏈。
研究人員表示,“糖胺聚糖是一個復(fù)雜的序列庫,就像莎士比亞的作品一樣,是一個復(fù)雜的字母集合。我們已經(jīng)訓(xùn)練了一臺機(jī)器,讓它能夠快速閱讀相當(dāng)于四個字母的單詞,如‘ababab’或‘bcbcbc’這些都是沒有任何意義的簡單序列,但它們展示了機(jī)器是可以被教會閱讀的。如果擴(kuò)展和發(fā)展這項技術(shù),它有可能實時測序聚糖甚至蛋白質(zhì)。”
實驗中,最成功的機(jī)器學(xué)習(xí)模型產(chǎn)生了一個準(zhǔn)確率接近97%的分析結(jié)果。
研究人員總結(jié)稱,“糖胺聚糖序列中的信息含量大大超過類似數(shù)量的DNA或RNA,這意味著快速了解糖胺聚糖序列的能力可為理解生命的復(fù)雜生物化學(xué)過程打開了一個新的窗口。”“這一概念證明研究將創(chuàng)新的納米檢測方法與最先進(jìn)的機(jī)器學(xué)習(xí)工具聯(lián)系起來,并展示了跨學(xué)科思維拓展知識前沿的能力。”
本周發(fā)表在《美國國家科學(xué)院院刊》上的研究顯示,倫斯勒理工學(xué)院的一個小組表明,機(jī)器學(xué)習(xí)和圖像識別軟件可以根據(jù)糖鏈穿過晶片上的一個小孔時產(chǎn)生的電信號,快速準(zhǔn)確地識別糖鏈。
研究人員表示,“糖胺聚糖是一個復(fù)雜的序列庫,就像莎士比亞的作品一樣,是一個復(fù)雜的字母集合。我們已經(jīng)訓(xùn)練了一臺機(jī)器,讓它能夠快速閱讀相當(dāng)于四個字母的單詞,如‘ababab’或‘bcbcbc’這些都是沒有任何意義的簡單序列,但它們展示了機(jī)器是可以被教會閱讀的。如果擴(kuò)展和發(fā)展這項技術(shù),它有可能實時測序聚糖甚至蛋白質(zhì)。”
實驗中,最成功的機(jī)器學(xué)習(xí)模型產(chǎn)生了一個準(zhǔn)確率接近97%的分析結(jié)果。
研究人員總結(jié)稱,“糖胺聚糖序列中的信息含量大大超過類似數(shù)量的DNA或RNA,這意味著快速了解糖胺聚糖序列的能力可為理解生命的復(fù)雜生物化學(xué)過程打開了一個新的窗口。”“這一概念證明研究將創(chuàng)新的納米檢測方法與最先進(jìn)的機(jī)器學(xué)習(xí)工具聯(lián)系起來,并展示了跨學(xué)科思維拓展知識前沿的能力。”