根系的分析歷史也比較長(zhǎng)遠(yuǎn)了，在這樣的狀態(tài)之下，根系的研究方法也總結(jié)出來(lái)很多，從根系研究科學(xué)的開始到現(xiàn)在利用科學(xué)計(jì)算機(jī)技術(shù)，對(duì)根系的分析沒(méi)有變，變的只是分析的工具。現(xiàn)代根系分析系統(tǒng)的應(yīng)用使分析過(guò)程準(zhǔn)確。

        因?yàn)楦凳亲魑锏牡叵聽I(yíng)養(yǎng)器官，不僅為作物吸收土壤中的水分和養(yǎng)分，固定植株，更是氨基酸、激素等微量活性物質(zhì)合成與轉(zhuǎn)化的場(chǎng)所。對(duì)于根系的分析歷史如果追溯起來(lái)也是一本厚厚的歷史資料，美國(guó)植物生態(tài)學(xué)家經(jīng)典挖掘方法進(jìn)行根系研究，此后作物根系研究逐漸展開，但進(jìn)展緩慢。自20世紀(jì)80年代以來(lái)，隨著人們對(duì)根系重要性認(rèn)識(shí)的加強(qiáng)，以及研究方法和技術(shù)的不斷改進(jìn)，作物根系研究取得了重大進(jìn)展。

        根系分析系統(tǒng)的基本原理是將掃描系統(tǒng)與圖形分析軟件結(jié)合起來(lái)，利用圖像分析軟件對(duì)掃描的根系圖像進(jìn)行分析，計(jì)算出根系長(zhǎng)度、表面積、體積、根尖數(shù)量等指標(biāo)。其中系統(tǒng)可以拍攝根系的立體光照片，是非破壞性的原位分析系統(tǒng)，非常適合于研究植物根系對(duì)脅迫的動(dòng)態(tài)響應(yīng)。根系分析系統(tǒng)的應(yīng)用降低了研究者對(duì)根系參數(shù)獲取的難度，但高準(zhǔn)確度以及對(duì)大田植株整體根系的動(dòng)態(tài)監(jiān)測(cè)還難以實(shí)現(xiàn)。

        賽亞斯根系分析系統(tǒng)/根系圖像分析儀/根系圖像分析系統(tǒng)/植物根系圖像監(jiān)測(cè)分析系統(tǒng)按成像方式不同，可分為對(duì)原位根系圖像的分析儀，以及對(duì)洗根后的根系圖像分析儀。一般都要求可分析根系的長(zhǎng)度、直徑、面積、體積根尖數(shù)、分叉數(shù)、根交叉數(shù)等。

       專業(yè)些的根系分析系統(tǒng)，還可分析植物根系的主側(cè)根拓?fù)湫螒B(tài)關(guān)系、連接關(guān)系，以及根尖部位的色彩變化，以便進(jìn)行根系形態(tài)和構(gòu)造研究。根系分析系統(tǒng)應(yīng)具備大批量圖像的全自動(dòng)分析特性，用戶可對(duì)自動(dòng)分析結(jié)果進(jìn)行局部的交互編輯修正，以確保數(shù)據(jù)的科學(xué)性。

        對(duì)原位根系圖像，因根系與土壤的顏色可能非常接近，故國(guó)內(nèi)外均采用圖像中根系目標(biāo)的自動(dòng)增強(qiáng)后，以交互引導(dǎo)的方式進(jìn)行標(biāo)記分析的。

        另外，還有引入分形維數(shù)，以及直方圖投影來(lái)進(jìn)行根系整體生物量分析的。根系分析的還可分析根瘤菌體積在根系中的占比，以客觀確定根瘤菌體的貢獻(xiàn)量。