毛細管色譜柱經(jīng)過一段時間的使用后不可避免地會被污染，尤其是進樣端柱頭。所以毛細管柱的保養(yǎng)是很重要的。

毛細管柱的日常保養(yǎng)，每天在正式做分析實驗前，應(yīng)使用程序升溫方式運行幾個循環(huán)，升溫速率可以快些，如：10～20℃/min，最高溫度應(yīng)比正式分析程序高5～10℃，但盡量不要高于色譜柱規(guī)定的最高操作溫度。

用一段時間后，特別是看到色譜峰明顯展寬、分離度下降、峰形撕裂、基線升高、基線漂移、或是無規(guī)律的出現(xiàn) 鬼峰 等現(xiàn)象，這都預(yù)示色譜柱（也包括汽化室襯管）已被污染。對于交聯(lián)固定相的毛細管柱可以用溶劑進行清洗，污染較輕的可用5～10mL正己烷清洗，污染較嚴(yán)重的可用5～10mL二氯甲烷清洗。清洗時要讓溶劑從毛細管柱出口（接檢測器一端）進，進口（接汽化室一端）出，溶劑全部流出毛細管柱后要用氮氣將殘留在柱內(nèi)的溶劑吹凈。最后根據(jù)毛細管柱的污染情況，將進口端（接汽化室一端）截去20～50cm。將色譜柱重新裝到氣相色譜儀上，用程序升溫方式運行幾個循環(huán)，前幾個循環(huán)升溫速率不要快，一般在5℃/min，最高溫度應(yīng)比正式分析程序高5～10℃，但一定不要高于色譜柱規(guī)定的最高操作溫度。保持時間不要長，3～5min即可。最好也不要接到檢測器上，特別是質(zhì)譜檢測器、電子俘獲檢測器等。然后可以通過常規(guī)實驗檢測的標(biāo)準(zhǔn)品或樣品進樣，檢查色譜柱是否恢復(fù)正常。如果無法恢復(fù)正常了，就該換新的了。