由于超純水對周遭環(huán)境物質有很高的溶解能力，因而被稱為”hungry water”，隨著取水后貯存時間的增加，會再度將環(huán)境中的污染物質溶解。超純水從超純水系統(tǒng)取出后，運送到實驗操作的場所為止，超純水很容易受到所使用容器之溶出物或是空氣中的污染物質的污染，進而影響到實驗的結果。因此，超純水取水后的處理非常重要。 由于超純水被取出后很容易遭到環(huán)境的污染，所以使用前才取水的隨取隨用方式是最適當?shù)?。只要超純水與環(huán)境接觸的時間縮到極短，才能夠獲得純度極高的超純水。此外，將實驗室超純水器與有機溶劑使用場所加以隔離，或是在化學抽風柜、無菌操作臺進行取水，也能夠降低污染。若無法做到前述要求，在研究室進行換氣通風動作也會有一些效果。
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